นักวิทยาศาสตร์อธิบายว่าสิ่งมีชีวิตหลากหลายชนิดอยู่ร่วมกันในชุมชนจุลินทรีย์ได้อย่างไร

ความหลากหลายในชุมชนทางชีวภาพหลายแห่งเป็นสัญญาณของระบบนิเวศที่สมดุล เมื่อสายพันธุ์หนึ่งครอบงำ ระบบทั้งหมดอาจยุ่งเหยิง ตัวอย่างเช่น การเพิ่มจำนวนมากเกินไปอย่างไม่มีการควบคุมของสาหร่ายทะเลบางชนิดทำให้เกิดกระแสน้ำสีแดงที่เป็นพิษซึ่งคร่าชีวิตปลาและสิ่งมีชีวิตในทะเลอื่นๆ และทำให้มนุษย์ป่วย ในระดับปัจเจกบุคคล ลำไส้ของมนุษย์เป็นที่อยู่ของชุมชนขนาดใหญ่ของแบคทีเรียต่างๆ ซึ่งมีความสำคัญต่อการย่อยอาหารและการดูดซึม สารอาหาร ที่เหมาะสม การหยุดชะงักหรือความไม่สมดุลของชุมชนแบคทีเรียนี้อาจทำให้เกิดการเจริญเติบโตของสายพันธุ์ที่เป็นพิษ ทำให้เกิดอาการคลื่นไส้ ท้องเสีย และอาการเจ็บป่วยอื่นๆ มีความจำเป็นเร่งด่วนที่จะต้องเข้าใจว่าความหลากหลายของชุมชนจุลินทรีย์ได้รับการพัฒนาและบำรุงรักษาอย่างไร โดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อกิจกรรมของมนุษย์เปลี่ยนแปลงสภาพแวดล้อมภายนอกและภายในของเรา